Sposób na wywołanie skryptu php to:

* * * * * /usr/local/bin/php sciezka/do/skryptu/skrypt php

oczywiście w Twoim wypadku ścieżka do interpretera php może się różnić, czasem wystarczy też samo "php". Nie wiem czy w ten sposób wykona skrypt JS bo nigdy nie miałem takiej potrzeby, ale na pewno ...